马六甲孔教会成立日期无从查考。根据早期重组孔教会时，从一些老前辈口中获悉，约在1950年成立，并租下板底街桥头的一间双层板屋作为“联邦圣教总会”会所。早期会长由德高望重的吴 仲坦先生坦任。此乃孔教会复兴的初期。

		吴仲坦先生
	联邦聖教总会会址

当时孔教会纯粹是一间带有浓厚宗教色彩的组织。他们把孔子当作神明来奉祀，烧香礼拜及坐禅修道，农历七月还举办“盂兰胜会”，每年大成节(孔子诞辰)皆举行庆祝仪式。

当年最热心会务的元老是廖新兴及杨紫沉两位老先生。后来鉴于会务停不前，会员人数日少，且都是上了年纪的商人，长期让它瘫痪下去，实非办法。后来景仰全马教总主席，即现任孔教会主席拿督沈慕羽局绅对孔子的敬仰有加，遂三顾茅庐，终于在1972年获得沈局绅首肯，毅然接受挽救孔教会的重任。接手后，当他首次踏进会所时，大吃一惊，整间屋楼呈现倾斜状态，屋顶与楼板已腐烂不堪，摇摇欲坠，犹如一座危楼。经商议后，认为重修会所当务之急，刻不容缓，遂邀请一些热心华文教育的有识之士，诸如：张錫山、陈住才、吴成家、林源瑞、林联登、余金添、李汉槎、刘文权、沈慕尧及徐俊明等参与重修整顿复兴工作，而早期的联邦圣教总会也迁至武吉峇汝新会所。经过数月的筹措奔波，终于向热心人士筹得2万余令吉，装修工程终于在1976年中完成。
廖君新兴	杨君紫沉	马六甲孔教会之父 拿督沈慕羽局绅

新届职员以新作风，进行推展会务，取消祭拜的宗教色彩，而改为注重孔子学术的研究，提倡儒家思想，处处以孔子的仁爱精神改造旧传统社会为宗旨。新届职员终于在1974年9月28日庆祝至圣先师孔子诞生2525周年纪念日产生，并宣誓就职。

重修后的会所，经一番设计布置后，焕然一新，并在1977年10月9日举行庆祝会所重修落成、孔圣塑像和图书馆揭幕典礼，该尊孔圣塑像是由主席征得中华民国侨委会报效，是用玻璃纤维调制而成，刻工精致，巍巍器宇，栩栩如生，供人瞻仰，孔教会传播儒家学順遂从此开始。

1983年，孔教会诸同仁深感要推展中华书法艺术，非有书法研习班的设立不可，并认为提倡书法运动是维护中华文化的一项神圣任务，何况本会是发扬中华文化的组织，设立华文书法班是符合本会宗旨，应积极进行。最后在林源瑞的建议下，遂通过成立书法班筹委会，并由学术股主任李汉槎校长草拟细则开始招生。1983年9月25日正式在会所成立孔教会书法研习班，报名参加者竟达60多名，学员包括：职业青年、出家人、男女教师、青少年及学生等。导师则由书法界知名人士担任，包括：沈慕羽局绅、曾锦祥师、谢如镜师、林书甫师、林国安师及林源瑞师等人，后来又增添颜徳泉师、蔡伟键师等人士。

孔教会书法研习班的创设，的确带动了马六甲华社及中学生学习中华书法的兴趣，纷纷开设书法班。

为了提高华文书法艺术的水准，20多年来本会曾先后邀请到百体书法家郑一峰先生、郑天炳校长、何维诚先生、黄金炳医生、黄崇禧先生等书法界知名人士前来作专题讲座，同时举办多届全国性沈慕羽局绅杯书法比赛、挥春赛、春联观摩会，并与其他团体联办或协办多场国际性的书法名家观赏会，邀请本外坡书法界知名人士现场当众挥毫示范，让年轻一代的书法爱好者大开眼界。

此外，本会历年来，每逢孔子诞辰纪念日，除在会所举办简单肃穆仪式外，也举办联欢晚宴，并恭请知名学者作专题演讲，先后受邀学者有：德国汉学家博吾康教授、玛拉工艺学院高级讲师赖观福硕士、中国报编辑黄崇禧、南洋商报总编辑张木钦、名作家唐彭、永乐多斯博士、历史学家李业霖、香港大学教授郑良树博士、佛总会长釋金明长老、慧海法师、孔学专家张弓、培风中学校长邓日才、赖兴祥、博爱辅导中心主任陈钦光等学者，他们的讲题多与孔子学说有关事迹，感人至深。

1995年受邀组团到孔子故里“曲阜”观光考察，并参加9月28日祭孔大典及出席国际孔子文化节开幕仪式。

2004年本会为了实现有个像样的“孔子之家”，而发动筹募兴建“孔子大厦”的呼吁，最后主席拿督沈慕羽登高一呼，果然得到“万山响应”，全马各地企业家、商界翘楚、热心商家，纷纷响应，慷慨解囊，玉成斯举，而文化界、报界也助以一臂之力，作出将伯之呼。如今全马这所唯一的“孔子大厦”终于在

2005年8月25日在马六甲文化街附近矗立起来，希望今后能成为研究“孔家学说”的大本营。